190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1404 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1404  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 308 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.1 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  28.77 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  25.22 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.69 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  26.47 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1527  putative iron-sulfur cluster-binding protein  21.81 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000239897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  31.01 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  30.47 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  31.03 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  28.37 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  31.21 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  27.07 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  30.25 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  24.4 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  28.68 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  28.68 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  26.84 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  28.68 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  33.57 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  27.73 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1320  putative iron-sulfur cluster binding protein  21.4 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000383466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3861  iron-sulfur cluster-binding protein  27.81 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  33.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  29.82 
 
 		 411 aa  53.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  29.82 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  30.7 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  29.82 
 
 		 411 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.79 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.12 
 
 		 379 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0771  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.81 
 
 		 391 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.885868  normal  0.0280629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  26.89 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.03 
 
 		 400 aa  52.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  30.7 
 
 		 379 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.41 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0745  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.08 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0556677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  27.67 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0007  hypothetical protein  30.77 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0733  4Fe-4S cluster binding  25.9 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  26.71 
 
 		 523 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  25.95 
 
 		 458 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0669  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.15 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.82 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  26.71 
 
 		 523 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.33 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.35 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  25.13 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.48 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.5 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  28.57 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.95 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  29.6 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.14 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  20.62 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3571  iron-sulfur cluster binding protein  26.35 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  29.08 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  26.72 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  28.68 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.68 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  27.97 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.68 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.32 
 
 		 428 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  24.41 
 
 		 380 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.95 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  30.43 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  27.63 
 
 		 445 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  23.86 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3193  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.22 
 
 		 393 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190045  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2545  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.6 
 
 		 375 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00348974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  27.91 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.53 
 
 		 355 aa  49.7  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  27.97 
 
 		 380 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.2 
 
 		 357 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2411  iron-sulfur cluster binding protein  23.28 
 
 		 383 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  28.57 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>