130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0353 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  89.06 
 
 
640 aa  1209    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  99.53 
 
 
640 aa  1320    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 
640 aa  1325    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  31 
 
 
463 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  30.04 
 
 
488 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  26.7 
 
 
458 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  33.04 
 
 
1070 aa  124  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  32.9 
 
 
1069 aa  123  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  29.89 
 
 
445 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  31.4 
 
 
345 aa  113  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  30.45 
 
 
399 aa  104  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.93 
 
 
491 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  31.13 
 
 
474 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  30.59 
 
 
489 aa  98.2  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  28.72 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.85 
 
 
484 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.98 
 
 
474 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  25.54 
 
 
455 aa  94  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  24.58 
 
 
455 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  25.06 
 
 
455 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  28.79 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  26.41 
 
 
352 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  26.91 
 
 
507 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  28.12 
 
 
532 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  26.09 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  26.56 
 
 
515 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  25.77 
 
 
509 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  25.77 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  25.39 
 
 
550 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  25.39 
 
 
515 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  25.38 
 
 
506 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.87 
 
 
532 aa  80.9  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  26.78 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  28.24 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  28.06 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  23.05 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  25.7 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  22.74 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  23.33 
 
 
507 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  25.35 
 
 
470 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  31.25 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  31.25 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  25.89 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  23.67 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  23.84 
 
 
508 aa  73.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  25.37 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  27.08 
 
 
429 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  23.13 
 
 
494 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  23.05 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  23.45 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  23.03 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  25.82 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  23.73 
 
 
495 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  24.06 
 
 
505 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  23.55 
 
 
495 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  25.84 
 
 
518 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  21.78 
 
 
491 aa  65.1  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  25.8 
 
 
473 aa  64.7  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  21.33 
 
 
493 aa  64.7  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  25 
 
 
490 aa  64.3  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  23.83 
 
 
510 aa  64.3  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  26.01 
 
 
554 aa  63.9  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  27.08 
 
 
523 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  22.85 
 
 
516 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  23.36 
 
 
488 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  23.64 
 
 
499 aa  63.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  26.67 
 
 
523 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  23.21 
 
 
469 aa  61.6  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  24.44 
 
 
505 aa  60.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  24.29 
 
 
492 aa  60.5  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  23.36 
 
 
481 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  30.12 
 
 
497 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  23.23 
 
 
505 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.69 
 
 
231 aa  57.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.4 
 
 
265 aa  57.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  22.66 
 
 
514 aa  57.4  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  22.18 
 
 
514 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  23.86 
 
 
510 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  23.27 
 
 
514 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.52 
 
 
226 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  24.82 
 
 
492 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  23.64 
 
 
229 aa  54.7  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  25.86 
 
 
496 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  25.86 
 
 
496 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  25.86 
 
 
496 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  24.74 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  22.33 
 
 
499 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0117  hypothetical protein  33.62 
 
 
105 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  21.85 
 
 
475 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.45 
 
 
268 aa  52.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.73 
 
 
263 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  29.23 
 
 
392 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  27.34 
 
 
149 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  22.87 
 
 
385 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.48 
 
 
357 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  25.52 
 
 
374 aa  48.9  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  28.93 
 
 
314 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  26.95 
 
 
383 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  29.46 
 
 
353 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.53 
 
 
238 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>