61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1496 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1496  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1382  hypothetical protein  38.34 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  29.03 
 
 
259 aa  62.8  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.73 
 
 
268 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.53 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.45 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.01 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.95 
 
 
233 aa  55.1  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.04 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  46.15 
 
 
399 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.54 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  31.15 
 
 
318 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  29.01 
 
 
364 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  29.45 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.42 
 
 
236 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  24.34 
 
 
374 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  26.83 
 
 
370 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.51 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.28 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.47 
 
 
243 aa  48.5  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  27.43 
 
 
330 aa  48.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.92 
 
 
386 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.67 
 
 
367 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  24.85 
 
 
363 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  27.87 
 
 
383 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.36 
 
 
442 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.74 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  32.14 
 
 
267 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  29.89 
 
 
314 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  23.78 
 
 
383 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  28.07 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  25.13 
 
 
363 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.52 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  32.2 
 
 
306 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  30 
 
 
308 aa  45.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.24 
 
 
382 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  28.23 
 
 
311 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  31.47 
 
 
324 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  27.73 
 
 
389 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  22.89 
 
 
325 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.94 
 
 
374 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.99 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.56 
 
 
282 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  25.85 
 
 
344 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  28.23 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.52 
 
 
380 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.52 
 
 
380 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  28.57 
 
 
380 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.63 
 
 
640 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.63 
 
 
640 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.03 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  25 
 
 
357 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1404  iron-sulfur cluster-binding protein  28.7 
 
 
308 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.2 
 
 
263 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  22.58 
 
 
380 aa  42  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  32.35 
 
 
182 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.17 
 
 
445 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  23.5 
 
 
347 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0493  protein of unknown function DUF1730  26.89 
 
 
404 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
323 aa  41.6  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  25.88 
 
 
404 aa  41.6  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>