265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1320 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1527  putative iron-sulfur cluster-binding protein  98.18 
 
 		 330 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000239897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1320  putative iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 330 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000383466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  54.1 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  37.79 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  33.12 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  33.44 
 
 		 389 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.79 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  34.67 
 
 		 363 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.82 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  31.49 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  31.49 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  31.49 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.82 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.82 
 
 		 380 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.3 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  29.87 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.52 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.22 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.22 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  30.43 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  27.96 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  28.33 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  29.14 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  33.08 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  24.84 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.73 
 
 		 382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.72 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0507  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.09 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  28.16 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  26.76 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  24.68 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.56 
 
 		 388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  25.89 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  27.4 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.92 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  29.69 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  27.52 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  25.48 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  24.92 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.1 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  25.85 
 
 		 323 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.3 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  28.8 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0460  hypothetical protein  26.91 
 
 		 398 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  28.52 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.12 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2257  domain of unknown function DUF1730  30.72 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.340392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  28.14 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.52 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  27.07 
 
 		 438 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  31.35 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  29.11 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.07 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  27.18 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  25 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  23.81 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  27.95 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.4 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.11 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  26.56 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  23.87 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  27.13 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  24.36 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  26.2 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  27.95 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  24.81 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.44 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  27.91 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  27.25 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  23.55 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.51 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  25.89 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  28.33 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  22.26 
 
 		 389 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  27.53 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00061  hypothetical protein  30.15 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0724  iron-sulfur cluster binding protein, putative  25.53 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602669  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1141  domain of unknown function DUF1730  23.73 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.28 
 
 		 372 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.53 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.53 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  26.52 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  26.52 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  27.89 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  28.4 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  26.52 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  26.52 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  25.83 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  26.52 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  26.85 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  26.52 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  26.52 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  29.15 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  24.42 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  25.57 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  25.47 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>