51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1939 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  100 
 
 		 105 aa  217  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  54.37 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  54.37 
 
 		 104 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  51.55 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  51.55 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  51.92 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  54.64 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  50.96 
 
 		 105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  50.96 
 
 		 105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  50 
 
 		 105 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  50.96 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  50.52 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  52.58 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  53.12 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  40.82 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  35.05 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  32.05 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  32.61 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 913 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  34.38 
 
 		 373 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  31.31 
 
 		 373 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  29.29 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  31.31 
 
 		 376 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  27.18 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1604  hypothetical protein  34.18 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0471  hypothetical protein  34.18 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0586  hypothetical protein  34.18 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1631  hypothetical protein  34.18 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0674  hypothetical protein  34.18 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1657  hypothetical protein  34.18 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5617  hypothetical protein  34.18 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.623415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  27.72 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  32.61 
 
 		 376 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  28.16 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  37.25 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 157 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3162  hypothetical protein  29.76 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00846617  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  26.32 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  29.17 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  29.17 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 710 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  28.75 
 
 		 99 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>