45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0781 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  56.84 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  61.86 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  55.79 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  55.79 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  64.21 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  51.58 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  40.21 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  47.37 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  37.33 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  39.51 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  32.61 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  37.84 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  44 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  33.65 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  33.65 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  46 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1218  sterol-binding domain-containing protein  40.26 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  36.36 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  47.92 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  32 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  34.74 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  35.42 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  42.31 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  42.31 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  31.25 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  32.1 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  33.33 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  47.83 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  47.83 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  26.76 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 150 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2385  SCP-2 sterol transfer family protein  30.23 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2015  Sterol-binding domain protein  30.23 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  32.98 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  25.35 
 
 		 183 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>