26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1890 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  90.71 
 
 		 183 aa  343  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4957  hypothetical protein  23.81 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  48.98 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  46.3 
 
 		 117 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  31.18 
 
 		 116 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3107  sterol-binding domain-containing protein  24.87 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0226  sterol-binding domain-containing protein  24.85 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  45.1 
 
 		 104 aa  47.8  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  39.58 
 
 		 110 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  39.58 
 
 		 110 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  39.58 
 
 		 110 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  39.13 
 
 		 93 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 103 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  23.76 
 
 		 106 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 111 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  37.25 
 
 		 105 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  35.29 
 
 		 110 aa  40.8  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>