24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1562 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  91.49 
 
 		 94 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  91.49 
 
 		 94 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  56.84 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  57.73 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  56.38 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  48.42 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  39.19 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  34.21 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  38.96 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  36.67 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  35 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  35.16 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1218  sterol-binding domain-containing protein  46.55 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  31.63 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  38.46 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  30.43 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  48.78 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  48.78 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  37.84 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  48.78 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  42 
 
 		 110 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>