41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3088 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  57.14 
 
 		 98 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  48.94 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1218  sterol-binding domain-containing protein  52.63 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  45.74 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  40.21 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  42.17 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  43.84 
 
 		 99 aa  67  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  41.67 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  39.02 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  43.21 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  39.29 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  40.48 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  35.71 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  39.29 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1980  hypothetical protein  32.58 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.428299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  36.59 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  36.59 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  36.59 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  39.02 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  35 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  40.79 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  36.59 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  35 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  34.57 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  34.57 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  33.73 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  30.1 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1743  hypothetical protein  47.92 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6473  Sterol-binding domain protein  42.55 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  28.75 
 
 		 105 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>