15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1743 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0779  hypothetical protein  56.69 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0785  hypothetical protein  55.91 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.251796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1552  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.781593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  40.66 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  48.08 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  46.15 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  47.06 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  47.92 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  44.44 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  44.68 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  45.1 
 
 		 105 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  47.06 
 
 		 104 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>