20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6473 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6473  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 114 aa  238  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  36.11 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  36.11 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  36.11 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  33.96 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  35.64 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  35.87 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 710 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 		 913 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  26.21 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  29.21 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  29.21 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  30.34 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  29.21 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  27.03 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  42.55 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>