25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1002 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  221  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6473  Sterol-binding domain protein  35.64 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  30.1 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  28.3 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  28.3 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  28.3 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  40.79 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  30.77 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  30.77 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  28.87 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  31.43 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  31.31 
 
 		 104 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  36.36 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  31.43 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  31.43 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  29.91 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  29.89 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  30 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>