23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4446 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  196  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  40.7 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  40.4 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  32.99 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  38.67 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  35.16 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  35.11 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  35.53 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  27.96 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  27.96 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  27.96 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  39.47 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  27.66 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  36.23 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  27.96 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  28.16 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  26.67 
 
 		 104 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  30.26 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  26.21 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>