26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2819 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  100 
 
 		 98 aa  196  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  57.14 
 
 		 99 aa  117  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  46.81 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  46.88 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  41.84 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  42.67 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1218  sterol-binding domain-containing protein  45.74 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  32.61 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  34.38 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  43.75 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  43.75 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  43.75 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1980  hypothetical protein  35.37 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.428299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  43.48 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  33.33 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4446  sterol-binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.700528  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  41.3 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  35.29 
 
 		 116 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.25 
 
 		 376 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>