35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3313 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  100 
 
 		 99 aa  191  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  61.86 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  58.95 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  57.73 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  57.73 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  57.73 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  55.67 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  39.02 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  34.41 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  35.37 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  36.84 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  42.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  34.83 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  33.33 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  50 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  39.24 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  50 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  50 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  37.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1218  sterol-binding domain-containing protein  43.84 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  36.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  36.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  53.06 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  38.98 
 
 		 104 aa  42  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  37.29 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  35.59 
 
 		 105 aa  40.8  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  37.29 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  37.29 
 
 		 105 aa  40  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 106 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  34.52 
 
 		 116 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>