26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1772 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  32.05 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  33.77 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  33.77 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  32.14 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  24.76 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 913 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  23.36 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3015  Sterol-binding domain-containing protein  29.49 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.19531  normal  0.172017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  29.49 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  28.57 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  28.21 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191234  normal  0.451021 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  31.03 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  28.21 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  26.92 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  35.94 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  21.88 
 
 		 110 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  21.88 
 
 		 110 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>