21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0558 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0558  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  45.59 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3015  Sterol-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.19531  normal  0.172017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  40.56 
 
 		 212 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1303  hypothetical protein  29.37 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3434  hypothetical protein  27.89 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  29.41 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  25 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  25.49 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  23.36 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  24.51 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  24.51 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.22 
 
 		 913 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  25.74 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  29.46 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  23 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  31.73 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>