226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0452 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0452  ROK family protein  100 
 
 		 368 aa  744    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00127145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1822  ROK family protein  39.3 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.720811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0527  ROK family protein  29.81 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0541  ROK family protein  29.5 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0625094  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.29 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.63 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.95 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.58 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.07 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  22.48 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  24.18 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.05 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.23 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.05 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  23.88 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  28.85 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  21.85 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  23.17 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  25.56 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  25.09 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  21.5 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  24.23 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  26.17 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.61 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.59 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.4 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  23.32 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  22.6 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  26.72 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  23.33 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  22.56 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  19.23 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.77 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  22.71 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  23.93 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  24.29 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  26.02 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  24.29 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  29.53 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  24.29 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  25.56 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  24.53 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  27.5 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.8 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  24.29 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  24.29 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  22.77 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  24.29 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  24.7 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2815  ROK family protein  21.32 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231049  normal  0.37172 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  24.29 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  24.29 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  24.29 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  24.71 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  23.08 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  27.89 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  20.53 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  25.1 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  20.73 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.4 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  25.46 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.4 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  22.27 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  24.4 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  21.58 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  22.8 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  20.96 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.4 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  24.29 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  20.8 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  25.09 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  25 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  22.96 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  25.2 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  25.1 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  21.02 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  22.96 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  24.85 
 
 		 244 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  26.06 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  23.14 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.03 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  25.51 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  25.4 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  22.73 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  22.73 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  22.8 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  21.41 
 
 		 400 aa  52.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  19.16 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  22.48 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  25.93 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  22.79 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1913  ROK family protein  25 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.435171  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  24.81 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  20.06 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  21.55 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  21.62 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  22.22 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  23.16 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>