251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1822 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1822  ROK family protein  100 
 
 		 318 aa  643    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.720811  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0452  ROK family protein  39.3 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00127145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0541  ROK family protein  28.47 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0625094  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0527  ROK family protein  28.47 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.82 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.74 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.9 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.47 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  28.37 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.27 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  24.21 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.01 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  24.14 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  23.16 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 404 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  23.51 
 
 		 425 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  28.28 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  24.22 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  21.09 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  23.18 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  21.79 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  23.02 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  22.74 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  23.78 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  21.09 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  22.06 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.89 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  25.76 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  26.44 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.79 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  23.02 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  22.46 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  22.11 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.85 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  21.07 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.1 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  24.77 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.76 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.35 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  28.85 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  25.51 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  25.15 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  23.65 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  22.3 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  22.53 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  26.15 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  22.34 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  22.34 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  21.86 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  22.34 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  26.89 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  19.39 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  23.96 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  25 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  22.44 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  21.99 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  23.58 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  22.7 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  22.49 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  23.16 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  22.73 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  25.47 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  23.15 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  22.49 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  22.49 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  23.97 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  25.81 
 
 		 376 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  23.28 
 
 		 425 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  22.15 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  22.15 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  25.97 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  22.15 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  22.15 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  22.15 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  22.15 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  21.86 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  27.36 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  21.29 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  23.61 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  22.82 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  30.04 
 
 		 405 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  24.42 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  22.56 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.49 
 
 		 396 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  22.38 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  21.58 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  19.44 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.46 
 
 		 407 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  20.65 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  26.34 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  26.85 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  21.86 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  18.82 
 
 		 442 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  20.49 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  24.19 
 
 		 406 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0714  xylose operon regulatory protein  23.67 
 
 		 402 aa  53.1  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.92 
 
 		 396 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  20.63 
 
 		 397 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>