More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6893 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  100 
 
 
244 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  59.76 
 
 
281 aa  292  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  64.88 
 
 
270 aa  289  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  58.2 
 
 
282 aa  285  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  64.07 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  61.57 
 
 
260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  58.68 
 
 
275 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  58.87 
 
 
278 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  58.33 
 
 
248 aa  274  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  61.9 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  59.67 
 
 
254 aa  271  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  54.73 
 
 
252 aa  268  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  58.26 
 
 
247 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  63.4 
 
 
268 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  55.93 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  55.46 
 
 
246 aa  260  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  56.36 
 
 
258 aa  254  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  55.08 
 
 
253 aa  254  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  51.03 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  55.51 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  54.81 
 
 
267 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  53.28 
 
 
245 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  52.72 
 
 
272 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  52.72 
 
 
265 aa  248  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  56.02 
 
 
270 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  54.98 
 
 
266 aa  248  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  54.55 
 
 
255 aa  248  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  51.97 
 
 
271 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  51.22 
 
 
255 aa  246  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  53.56 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  53.56 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  56.33 
 
 
262 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  53.56 
 
 
269 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  49.8 
 
 
257 aa  236  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  50.6 
 
 
274 aa  235  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  54.31 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  53.02 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  51.43 
 
 
258 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  40 
 
 
239 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  40.28 
 
 
235 aa  138  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  38.98 
 
 
292 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  34.78 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  36.51 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  35.29 
 
 
245 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  33.73 
 
 
256 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  33.2 
 
 
259 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  33.65 
 
 
254 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  32.38 
 
 
266 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  28.8 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  29.3 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.39 
 
 
319 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  32.03 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.23 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.72 
 
 
298 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.19 
 
 
313 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.41 
 
 
297 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.41 
 
 
297 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.06 
 
 
311 aa  85.1  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.61 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  27.15 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  30.13 
 
 
314 aa  75.1  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  28.43 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.44 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.57 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.1 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  30.93 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  24.58 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  29.77 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  25.25 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  30.64 
 
 
315 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  27.59 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  36.2 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  31.79 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  35.29 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26.81 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.74 
 
 
389 aa  65.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.75 
 
 
352 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  27.65 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  30.43 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  26.1 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  26.51 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  32.3 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  31.09 
 
 
314 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  28.09 
 
 
313 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  28.57 
 
 
289 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  24.32 
 
 
299 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.14 
 
 
328 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  25.93 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  31.25 
 
 
301 aa  62  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.54 
 
 
313 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  31.76 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  27.67 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  25 
 
 
304 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  25 
 
 
304 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  25 
 
 
304 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>