More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1484 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  67.59 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  63.93 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  66.11 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  64.29 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  62.4 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  58.44 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  58.65 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  59.43 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  59.67 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  58.05 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  58.9 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  57.08 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  55.24 
 
 		 265 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  56.18 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  52.76 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  57.38 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  52.92 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  55.69 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.5 
 
 		 272 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  53.12 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.91 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  53.97 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  53.06 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  54.32 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  55.65 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  54.58 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  53.23 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  53.5 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  53.5 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  53.5 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  54.94 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  50 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  52.23 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  52.26 
 
 		 245 aa  228  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  51.93 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  46.5 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  48.92 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  38.71 
 
 		 235 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  38.25 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  35.21 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  36.84 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  32.85 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  31.97 
 
 		 266 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  31.56 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  33.47 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  28.91 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  28.97 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  33.91 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.21 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.57 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  24.68 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.64 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.64 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  39.2 
 
 		 319 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.81 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  27.18 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.42 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  27 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.39 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.56 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.58 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  36.53 
 
 		 320 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  27 
 
 		 289 aa  72  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  31.78 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  35.93 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  35.93 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  26.78 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  35.19 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.62 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.14 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  25.51 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.84 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  33.33 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  25.62 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  35.5 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  33.33 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  29.32 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  27.89 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  30.64 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  26.6 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  34.73 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  35.1 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  32.2 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  30.15 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  28.87 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0418  ROK family protein  24.63 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.370137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.87 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  24.36 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  26.6 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  30.63 
 
 		 310 aa  62  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  26.06 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  34.88 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  25.57 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.17 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  30.77 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  25.99 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  34.68 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.43 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>