More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  67.19 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  71.55 
 
 		 258 aa  340  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  70.21 
 
 		 271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  64.23 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  65.4 
 
 		 268 aa  294  8e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  58.92 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  57.85 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  56.57 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  60.96 
 
 		 262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  58.75 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  53.06 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  56.2 
 
 		 244 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  52.87 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  52.24 
 
 		 281 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  53.2 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  52.05 
 
 		 247 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  50.19 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  51.05 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  52.94 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  52.02 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  54.39 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  52.74 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  53.04 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  53.07 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  50.43 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  49.2 
 
 		 270 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  46.96 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  51.97 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  49.34 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  48.37 
 
 		 275 aa  225  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  45.75 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  45.87 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  48.99 
 
 		 269 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  44.94 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  48.58 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  48.58 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  44.63 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  36.29 
 
 		 235 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  36.1 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  34.85 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  36.1 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  32.95 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.65 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  31.64 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.7 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.27 
 
 		 297 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.28 
 
 		 298 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  30.2 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  30.51 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.03 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.03 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.93 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  29.57 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.67 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  28.63 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.15 
 
 		 313 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  31.35 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.99 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  30.12 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  30.62 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  30.62 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  25.09 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  25.61 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.44 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  29.51 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  27.64 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  28.23 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  34.48 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  28.23 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  27.67 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.65 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  24.16 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  23.69 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  28.96 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.74 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  22.65 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  24.08 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  26.38 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  24.17 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  29.5 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1025  sugar kinase  30.48 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0410056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  31.69 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.61 
 
 		 328 aa  62  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  27.94 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18441  ROK family protein  28.67 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  28.57 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  26.85 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.42 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  27.65 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.81 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.81 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  26.95 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  29.6 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0926  sugar kinase  28.47 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>