80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2621 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  100 
 
 
257 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  77.96 
 
 
252 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  77.87 
 
 
256 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  77.02 
 
 
255 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  45.24 
 
 
274 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  40.4 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  38.25 
 
 
266 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  37.55 
 
 
259 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  38.06 
 
 
239 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  35.86 
 
 
245 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  39.29 
 
 
292 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  33.33 
 
 
254 aa  165  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  37.04 
 
 
235 aa  165  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  34.78 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  34.66 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  34.11 
 
 
260 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  32.94 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  33.73 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  33.07 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.95 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  29.73 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  33.6 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  30.31 
 
 
270 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  33.63 
 
 
255 aa  92  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  34.11 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  32.79 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  32.05 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  30 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  30.09 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  32.4 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  32.81 
 
 
248 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.28 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  30.92 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.97 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  30.74 
 
 
271 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  28.29 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.92 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.15 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  28.36 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  32.16 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  36.4 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  29.6 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  34 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  33.89 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  30.86 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  32.07 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  32.07 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  32.07 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  33.91 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  28.85 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  32.02 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  30.4 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  31.2 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  25.62 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  32.39 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  32.1 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  30.43 
 
 
363 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.03 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  26.42 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  28.78 
 
 
409 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.12 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  28.42 
 
 
312 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  35.22 
 
 
321 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  28.75 
 
 
314 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  35.06 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  34.44 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  26.75 
 
 
299 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  31.41 
 
 
425 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  21.05 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  34.75 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  25.16 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.38 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  30.38 
 
 
315 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.04 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.04 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.23 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  25.26 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  25.43 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  24.72 
 
 
296 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.89 
 
 
425 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>