More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3319 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  100 
 
 
268 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  75.93 
 
 
260 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  66 
 
 
254 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  69.26 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  70.33 
 
 
262 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  65.4 
 
 
260 aa  318  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  65.95 
 
 
271 aa  316  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  64.17 
 
 
282 aa  315  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  62.81 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  65.82 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  63.49 
 
 
244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  62.4 
 
 
252 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  60.49 
 
 
253 aa  291  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  59.59 
 
 
281 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  59.02 
 
 
255 aa  285  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  60.59 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  60.08 
 
 
257 aa  278  5e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  58.78 
 
 
278 aa  275  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  57.14 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  60.09 
 
 
267 aa  268  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  58.65 
 
 
248 aa  267  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  50.57 
 
 
265 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  58.85 
 
 
270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  57.5 
 
 
247 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  57.26 
 
 
270 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  56.09 
 
 
266 aa  262  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  51.89 
 
 
274 aa  261  6.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  60.09 
 
 
267 aa  259  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.33 
 
 
275 aa  248  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  53.63 
 
 
258 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  51.87 
 
 
247 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  47.51 
 
 
267 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  52.61 
 
 
255 aa  239  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  49.37 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  49.79 
 
 
245 aa  231  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  50 
 
 
269 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  50 
 
 
269 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  49.4 
 
 
269 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  40 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  38.75 
 
 
239 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  39.04 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  33.33 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  32.52 
 
 
245 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  33.49 
 
 
254 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.93 
 
 
311 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  31.56 
 
 
266 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  34 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  31.84 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  31.91 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  33.46 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  34.36 
 
 
255 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.03 
 
 
298 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  34.38 
 
 
252 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.62 
 
 
319 aa  89.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.37 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  25.85 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.37 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  25.58 
 
 
302 aa  82  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  28.03 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  25.86 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.41 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  28.71 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  28 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  29.76 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  28.89 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.45 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  28.77 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  23.93 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.1 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  24.68 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  29.56 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0418  ROK family protein  26.37 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.370137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  34.71 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  30.85 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  24.91 
 
 
478 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  33.53 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  25.52 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.81 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  33.53 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  26.76 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  27 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  26.71 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  33.33 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  23.21 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  27.57 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.59 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  25.72 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  25.83 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  34.12 
 
 
320 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  32.32 
 
 
314 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  28.57 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.24 
 
 
387 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  28.38 
 
 
299 aa  62.4  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.86 
 
 
316 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  26.05 
 
 
325 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  26 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  28.65 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  35.47 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.48 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  26.82 
 
 
299 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>