More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  100 
 
 
255 aa  504  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  63.89 
 
 
254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  60.96 
 
 
252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  69.92 
 
 
268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  59.76 
 
 
260 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  63.75 
 
 
262 aa  284  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  57.81 
 
 
271 aa  275  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  59.66 
 
 
260 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  56.2 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  55.28 
 
 
246 aa  271  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  60.74 
 
 
258 aa  270  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  57.26 
 
 
253 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  54.51 
 
 
253 aa  265  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  54.18 
 
 
281 aa  264  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  55.6 
 
 
244 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  55.37 
 
 
255 aa  258  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  55.28 
 
 
278 aa  254  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  52.71 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  53.85 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  58.61 
 
 
270 aa  252  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  50.6 
 
 
255 aa  251  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  56.67 
 
 
248 aa  251  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  55.37 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  50.6 
 
 
265 aa  250  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  51.38 
 
 
257 aa  249  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  53.95 
 
 
267 aa  241  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  51.03 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  52.24 
 
 
270 aa  238  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  52.7 
 
 
258 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  53.07 
 
 
267 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  48.79 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  49.59 
 
 
267 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  47.93 
 
 
272 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  48.57 
 
 
245 aa  222  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  50 
 
 
269 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  50 
 
 
269 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  50 
 
 
269 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  48.05 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  38.57 
 
 
239 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  39.91 
 
 
235 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  36.45 
 
 
245 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  32.93 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  32.13 
 
 
266 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  34.82 
 
 
270 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  32.56 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  33.97 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.48 
 
 
313 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  32.68 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.49 
 
 
303 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.57 
 
 
298 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.38 
 
 
297 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.5 
 
 
319 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.73 
 
 
311 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  33.66 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  29.34 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  27.39 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  28.12 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  31.38 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  28.14 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  27.46 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  25.47 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  29.39 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  31.85 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  29.96 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.24 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.24 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.11 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  29.23 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.85 
 
 
325 aa  72  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  26.99 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  26.99 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  28.67 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  26.32 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  28.15 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  28.38 
 
 
478 aa  68.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.26 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  27.12 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  30 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  26.62 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  27.54 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  27.81 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.52 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  26.91 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  26.64 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  27.51 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.38 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.19 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  27.51 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  27.51 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  28.02 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  28.75 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  26.98 
 
 
342 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  26.17 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0418  ROK family protein  25.67 
 
 
291 aa  63.2  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.370137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  26.32 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  27.24 
 
 
313 aa  62.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  28.8 
 
 
299 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  29.18 
 
 
312 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>