161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  67.19 
 
 		 253 aa  331  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  65.57 
 
 		 247 aa  318  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  60.32 
 
 		 246 aa  308  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  56.75 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  57.55 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  55.56 
 
 		 272 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  54.1 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  58.2 
 
 		 260 aa  277  9e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  57.49 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  54.1 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  57.61 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  57.2 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  55.46 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  55.69 
 
 		 269 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  53.78 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  55.69 
 
 		 269 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  55.2 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  60.49 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  54.44 
 
 		 282 aa  262  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  55.6 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  53.97 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  57.37 
 
 		 262 aa  254  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  54.92 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  51.52 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  53.72 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  54.29 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  52.94 
 
 		 260 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  51.52 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  53.65 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  49.6 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  48.82 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  46.09 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  45.91 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  46.09 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  47.04 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  48.05 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  48.92 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  33.77 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  32.9 
 
 		 235 aa  122  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  33.61 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  32.92 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  30.95 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  30.95 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  31.6 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  30.09 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  28.3 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  28.45 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  28.23 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  28.76 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  25.76 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.74 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  28 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.07 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  24.92 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  26.09 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.09 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  23.89 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.67 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.8 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.8 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  36.05 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.49 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  31.61 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  23.81 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  25.42 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  32.24 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  33.73 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.06 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  24.51 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  24.39 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  29.88 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  26.26 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  27.71 
 
 		 314 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  24.41 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  25 
 
 		 400 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  25.44 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  33.33 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  23.69 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  23.69 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  30.49 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  25.77 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  25.59 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  30 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  32.35 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.49 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.49 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.49 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.49 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.69 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.49 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  25.25 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  26.25 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  26.25 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  26.25 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  34.17 
 
 		 298 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  26.71 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  23.79 
 
 		 313 aa  49.3  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.58 
 
 		 401 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>