68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 256 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  78.78 
 
 		 255 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  77.87 
 
 		 257 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  69.23 
 
 		 252 aa  348  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  50.61 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  42.04 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  40.65 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  40.08 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  36.63 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  38.02 
 
 		 235 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  39.84 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  40.74 
 
 		 292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  34.41 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  33.73 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  35.43 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  33.07 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  32.69 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  30.43 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  31.75 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  31.72 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  33.74 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  31.25 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  29.34 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  30 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  28.85 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  33.33 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.21 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  34.2 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.89 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  30.98 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  29.52 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  29.52 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  29.52 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  32.6 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  30.53 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  28.76 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  27.38 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  27.53 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  33.47 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  32.95 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  30.15 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  29.26 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  30.53 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.01 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  28.79 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  28.19 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  30.97 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  32.62 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  27.51 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  33.48 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  26.56 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  25.78 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  30.92 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  32.52 
 
 		 363 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.52 
 
 		 303 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.14 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.57 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3375  ROK family protein  23.08 
 
 		 342 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  32.69 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3376  ROK family protein  23.08 
 
 		 342 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00191545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.41 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  32.9 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3400  ROK family protein  23.08 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.454218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3153  ROK family protein  23.08 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.095994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  28.57 
 
 		 314 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  32.73 
 
 		 313 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>