251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0069 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  100 
 
 
245 aa  482  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  57.92 
 
 
248 aa  268  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  53.28 
 
 
244 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  50 
 
 
281 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  49.38 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  49.19 
 
 
278 aa  238  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  52.89 
 
 
270 aa  237  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  49.35 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  47.93 
 
 
282 aa  228  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  52.26 
 
 
254 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  47.26 
 
 
246 aa  220  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  45.76 
 
 
253 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  45.89 
 
 
255 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  48.55 
 
 
260 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  47.35 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  45.61 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  45.68 
 
 
247 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  48.05 
 
 
255 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  50.2 
 
 
262 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  43.1 
 
 
265 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  47.5 
 
 
270 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  44.58 
 
 
275 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  45.45 
 
 
253 aa  205  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  44.35 
 
 
267 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  49.36 
 
 
268 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  43.09 
 
 
255 aa  201  6e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  44.26 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  44.35 
 
 
269 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  44.35 
 
 
269 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  44.35 
 
 
269 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  40.89 
 
 
257 aa  194  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  42.13 
 
 
255 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  46.38 
 
 
258 aa  192  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  43.67 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  42.67 
 
 
267 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  42.67 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  40 
 
 
274 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  41.22 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  34.04 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  35.38 
 
 
239 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  34.03 
 
 
270 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  32.53 
 
 
266 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  32.13 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  33.33 
 
 
292 aa  98.6  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  33.07 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  28.99 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  30.29 
 
 
245 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  31.2 
 
 
274 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  30.43 
 
 
256 aa  89  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.04 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  30.63 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  30.27 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  30.56 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.99 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  30.05 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.9 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.81 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.81 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.51 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.16 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  27.88 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.34 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.38 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  29.78 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  32.55 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  23.79 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  24.92 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.54 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  24.74 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  23.45 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  23.45 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  27.8 
 
 
315 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  27.15 
 
 
307 aa  62.4  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.98 
 
 
302 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  23.67 
 
 
300 aa  61.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  30.3 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  24.5 
 
 
299 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  37.01 
 
 
313 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  25.17 
 
 
478 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  27.76 
 
 
340 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  26.92 
 
 
332 aa  58.9  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.08 
 
 
319 aa  58.9  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  23.57 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  23.83 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30.45 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  28 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  32.7 
 
 
325 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  27.18 
 
 
313 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  33.72 
 
 
314 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.51 
 
 
315 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  31.42 
 
 
313 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1098  ROK family protein  28.82 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0070439  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  33.54 
 
 
320 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  33.54 
 
 
320 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2823  ROK family protein  23.08 
 
 
283 aa  55.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  31.95 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  31.71 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  26.84 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  22.73 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  24.11 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>