More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1492 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  100 
 
 
271 aa  545  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  70.89 
 
 
260 aa  345  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  69.62 
 
 
258 aa  323  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  65.15 
 
 
260 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  65.97 
 
 
268 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  58.8 
 
 
254 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  58.3 
 
 
282 aa  287  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  57.85 
 
 
252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  60 
 
 
262 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  56.73 
 
 
255 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  57.81 
 
 
255 aa  276  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  50.41 
 
 
255 aa  258  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  52.7 
 
 
244 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  51.22 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  50.61 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  50.4 
 
 
257 aa  251  8.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  52.52 
 
 
246 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  51.61 
 
 
270 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  50.79 
 
 
270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  53.97 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  50 
 
 
274 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  53.95 
 
 
267 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  53.95 
 
 
267 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  48.12 
 
 
265 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  51.63 
 
 
258 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  51.05 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  47.52 
 
 
267 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  51.02 
 
 
278 aa  231  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  47.93 
 
 
272 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  49.36 
 
 
253 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  48.47 
 
 
266 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  50 
 
 
269 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  50 
 
 
269 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  50 
 
 
269 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  44.72 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  47.6 
 
 
255 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  44.81 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  44.63 
 
 
245 aa  195  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  35.34 
 
 
239 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  32.56 
 
 
254 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  35 
 
 
235 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  36.45 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  32.04 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  32.1 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.84 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.55 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.55 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.33 
 
 
303 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  29.46 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  27.88 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.14 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.24 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  30.74 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.91 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  37.78 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  36.23 
 
 
340 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  27.67 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  26.75 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  29.26 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  25.68 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  27.66 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  25.99 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  26.7 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  28.33 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  25 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  28.74 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  29.43 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  27.56 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  27.18 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  32.37 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  32.53 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  25.17 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  26.72 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  25.82 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  28.15 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.18 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  26.42 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  22.93 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  26.85 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.81 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  26.85 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  29.89 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  26.85 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  26.32 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  26.32 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  27.8 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  26.13 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  25.9 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  25.08 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  27.13 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.6 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  27.27 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  24.84 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  28.41 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  24.92 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  24.83 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  31.97 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.36 
 
 
400 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  27.91 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>