292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1879 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  69.87 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  67.63 
 
 		 265 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  62.81 
 
 		 272 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  62.14 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  64.73 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  64.73 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  64.73 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  60.33 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  62.4 
 
 		 254 aa  292  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  60.59 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  59.41 
 
 		 247 aa  284  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  57.61 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.47 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  55.46 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  54.89 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  54.69 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  57.02 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  51.9 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  55.06 
 
 		 270 aa  254  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  52.7 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  54.58 
 
 		 270 aa  251  9.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  52.19 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  53.59 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  50.64 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  51.87 
 
 		 258 aa  243  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  56.78 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  50.64 
 
 		 260 aa  241  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  49.15 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  50.41 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  51.54 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  51.74 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  47.52 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  45.82 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  51.53 
 
 		 267 aa  224  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  47.26 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  50.22 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  46.94 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  37.85 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  35.05 
 
 		 235 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  33.18 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  32.52 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  34.11 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  30.77 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  28.5 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  29.17 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  28.75 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  27.09 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.25 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  30.15 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.07 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.71 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  27.92 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.42 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.42 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  30.79 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.28 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  29.07 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.9 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  27.24 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  25.93 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  24.92 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.94 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.35 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  25.91 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  30.98 
 
 		 315 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  35.8 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  25.42 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  34.55 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  26.94 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  26.07 
 
 		 306 aa  62  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  25.26 
 
 		 287 aa  62  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  27.69 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.57 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  24.83 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  27.68 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.44 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  23.65 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  31.03 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  24.38 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  26.17 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  24.51 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  27.37 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  32.57 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  25.96 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  36.14 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  26.42 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  25.96 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.97 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  27.97 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.97 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.97 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.97 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.97 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  32.93 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.97 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  25 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  24.9 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  33.93 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  30.67 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>