More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0758 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  100 
 
 		 292 aa  584  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  55.56 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  53.33 
 
 		 235 aa  245  6.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  44.21 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  43.36 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  44.17 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  42.44 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  36.82 
 
 		 274 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  41.6 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  39.29 
 
 		 257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  40.74 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  40.24 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  37.45 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  38.98 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  38.16 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  35.38 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  38.25 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  33.61 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  35.02 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  36.36 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  35.12 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  36.45 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  36.54 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  41.48 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  37.92 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  36.84 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  36.84 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  34.87 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  35.44 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  32.45 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  33.62 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  35.05 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  35.43 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  30.87 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  36.24 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  38.52 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  31.78 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  33.33 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  35 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  33.18 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  34 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  33.97 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  34.58 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.36 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  33.78 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  32.56 
 
 		 248 aa  92  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  30.73 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  30.73 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  30.73 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.47 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  35.24 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  29.61 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  33.74 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.78 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.99 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  30.29 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  38 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  38 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  38 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  33.56 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  36.11 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  32.89 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.23 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  35.29 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.29 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  33.57 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  31.51 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  34.93 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  34.71 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  33.1 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  36.67 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.92 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  34.21 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.57 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  30.89 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.47 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  34.44 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  27.24 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  27.27 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  32.39 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  24.21 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  32.39 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.63 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  32.39 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  32.39 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  39.13 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  34.44 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  34.44 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  32.43 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  29.24 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.56 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  31.91 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  29.02 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  30.28 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.11 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  31.97 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  32.21 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  35.21 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.01 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>