257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1510 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  100 
 
 
253 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  67.19 
 
 
253 aa  342  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  64.46 
 
 
247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  60.64 
 
 
265 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  61.13 
 
 
246 aa  298  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  60.16 
 
 
275 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  60.82 
 
 
281 aa  292  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  58.85 
 
 
272 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  62.55 
 
 
244 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  59.67 
 
 
267 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  61.22 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  58.47 
 
 
254 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  56.91 
 
 
260 aa  272  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  60.91 
 
 
269 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  60.91 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  60.91 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  57.98 
 
 
255 aa  270  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  59.26 
 
 
270 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  57.26 
 
 
255 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  55.06 
 
 
282 aa  265  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  61 
 
 
268 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  57.54 
 
 
270 aa  256  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  58.3 
 
 
262 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  53.47 
 
 
252 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.68 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  51.26 
 
 
260 aa  238  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  53.33 
 
 
248 aa  238  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  50.21 
 
 
266 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  50.41 
 
 
258 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  50.39 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  51.72 
 
 
267 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  47.33 
 
 
247 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  54.31 
 
 
267 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  47.64 
 
 
257 aa  227  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  46.9 
 
 
255 aa  225  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  49.36 
 
 
271 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  46.48 
 
 
258 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  46.89 
 
 
245 aa  218  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  36.7 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  34.7 
 
 
235 aa  115  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  33.47 
 
 
259 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  32.38 
 
 
266 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  33.72 
 
 
292 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  32.92 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  31.1 
 
 
257 aa  89  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  30.27 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.39 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  28.02 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  30.04 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  29.38 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.93 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  28.91 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  27.67 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.16 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  25.82 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  27.06 
 
 
302 aa  72  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  27.2 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  28.52 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.87 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  26.89 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  25.08 
 
 
317 aa  63.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  32.02 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.54 
 
 
312 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.24 
 
 
297 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.24 
 
 
297 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  28.09 
 
 
301 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  25 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  37.08 
 
 
363 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  28.08 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  27.06 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.57 
 
 
342 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  25.09 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  25.09 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  29.94 
 
 
361 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  32.87 
 
 
396 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  32.93 
 
 
305 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  27.12 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  31.91 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  33.14 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3770  ROK family protein  28.88 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  24.67 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  29.47 
 
 
325 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  30.06 
 
 
325 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  27.54 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  27.57 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  29.01 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  25 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.43 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  25.91 
 
 
313 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  26.51 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  26.51 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  26.51 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  35.29 
 
 
299 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  27.54 
 
 
306 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  27.54 
 
 
306 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  29.23 
 
 
305 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  26.03 
 
 
289 aa  55.8  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.43 
 
 
306 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.07 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  37.88 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>