230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1252 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  100 
 
 		 281 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  74.1 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  61.94 
 
 		 260 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  59.76 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  60.43 
 
 		 253 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  56.91 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  54.4 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  57.79 
 
 		 248 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  55.06 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  54.22 
 
 		 265 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  52 
 
 		 272 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  53.72 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  56.98 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  56.18 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  54.51 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  56.43 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  55.46 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  53.47 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  50.41 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  55.98 
 
 		 262 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  59.58 
 
 		 268 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  54.88 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  52.08 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  54.24 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  52.5 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  52.54 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  52.78 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  52.78 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  50.41 
 
 		 245 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  53.04 
 
 		 269 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  49.6 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  50.83 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  50.43 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  51.28 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  49.05 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  48.05 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  51.71 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  35.34 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  35.08 
 
 		 239 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  37.92 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  29.85 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  31.05 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  32.94 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  30.52 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  30.88 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  29.13 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  33.63 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  32.69 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.1 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.83 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.83 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  29.83 
 
 		 297 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  32.35 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  29.66 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.14 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.91 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  27.87 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  26.74 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  36.36 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.84 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  27.12 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.35 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  35.29 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  27.99 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  26.67 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  29.49 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0418  ROK family protein  22.65 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.370137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.47 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  26.43 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  33.14 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  24.65 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  29.04 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.94 
 
 		 352 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  27.39 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  36.05 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  27.96 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  28.18 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  25.17 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  33.72 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  27.76 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  27.74 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  27.16 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  25 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  27.69 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  29.52 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  35.12 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  24.76 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  34.39 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  23.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  24.58 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  29.55 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  26.76 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  25.26 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.95 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>