More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1677 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  56.38 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  46.15 
 
 		 235 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  45.57 
 
 		 270 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  44.35 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  44.87 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  43.48 
 
 		 239 aa  211  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  43.36 
 
 		 292 aa  195  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  37.82 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  33.33 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  31.98 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  34.41 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  32.39 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  34.76 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  36.19 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  31.6 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  35.41 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  34.58 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  31.56 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  34.58 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  35.41 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  33.33 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  35.21 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  30.88 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  29.83 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  33.65 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  31.75 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  30.34 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  32.56 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  33.65 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  29.08 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.13 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.34 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  33.97 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  28.99 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  31.1 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  31.6 
 
 		 265 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  33.2 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.38 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  32.08 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  31 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  32.05 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  32.89 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  34.29 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  28.5 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  34.29 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  34.29 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  28.3 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  26.99 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  31.71 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  33.49 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  29.65 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.38 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.58 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  36.49 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  31.85 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  35.03 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.45 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  25.77 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  27.27 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  36 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.77 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  30.73 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.01 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  32.21 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.11 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  34.9 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  34.9 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  27.54 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2121  ROK family protein  32.68 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.12 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  33.55 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  33.56 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  24.2 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.14 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  32.19 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  29.71 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  34.93 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  29.41 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  30.68 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.34 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.52 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  27.78 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  23.84 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0926  sugar kinase  31.2 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  28.33 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  27.78 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  29.17 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  31.51 
 
 		 383 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  32.74 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  27.33 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  30.3 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  23.88 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  32.45 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  31.53 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.52 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  34.48 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.52 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>