78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7569 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  60.65 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  60.47 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  35.96 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  36.56 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  36.84 
 
 		 292 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  35.32 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  31.9 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  35.02 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  33.78 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  35.65 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  30.89 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  28.86 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  30.17 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  31.51 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  27.94 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  28.85 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  31.1 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  32.86 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  29.95 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  27.14 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  28.31 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  28.91 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  26.7 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  28 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  28 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  27.96 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  28 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  30.8 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  26.92 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  28.16 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  27.27 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  27.14 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  26.44 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  32.89 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  30.51 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  26.32 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  27.96 
 
 		 282 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  28.97 
 
 		 278 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  25.24 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  28.17 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.86 
 
 		 503 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  31.58 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  29.53 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  26.64 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  29.31 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.41 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.77 
 
 		 410 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  28.57 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.68 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  29.63 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  22.73 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  26 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.31 
 
 		 402 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  26.18 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  31.25 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  25.94 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  28.99 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.59 
 
 		 317 aa  46.2  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  25.81 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  28.97 
 
 		 313 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  28.19 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  31.65 
 
 		 299 aa  45.1  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.86 
 
 		 298 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.67 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.67 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  24.14 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  22.84 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.2 
 
 		 406 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  30.34 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  29.17 
 
 		 381 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  33.33 
 
 		 392 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  23.04 
 
 		 312 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  26.67 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8557  glucose kinase  32.05 
 
 		 376 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.48 
 
 		 390 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  22.4 
 
 		 307 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>