190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2399 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  80.08 
 
 		 259 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  78.52 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  47.66 
 
 		 245 aa  231  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  50.43 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  45.57 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  46.84 
 
 		 235 aa  219  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  45.31 
 
 		 274 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  44.17 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  40.4 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  39.59 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  42.04 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  41.2 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  37.45 
 
 		 236 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  34.82 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  34.85 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  36.92 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  33.74 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  33.87 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  36.51 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  36.15 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  35.32 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  32 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  37.02 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  34.03 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  34.01 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  32.37 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  32.79 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  36.51 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  31.28 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  30.96 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  32.78 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  30.47 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  34.57 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  33.93 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  31.82 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  32.87 
 
 		 281 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  32.27 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  32.11 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  32.52 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  33.47 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  33.05 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  34.66 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  30.04 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  30.04 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  30.04 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  33.48 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  30 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  33.05 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  32.79 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  32.02 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  31.98 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  31.58 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  34.67 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.37 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.13 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.49 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  34.62 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  33.33 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.55 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3517  N-acetylmannosamine kinase  40 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  27.39 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.76 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3704  N-acetylmannosamine kinase  40.31 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.338423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3554  N-acetylmannosamine kinase  39.53 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03082  N-acetylmannosamine kinase  39.53 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.64 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03033  hypothetical protein  39.53 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0484  N-acetylmannosamine kinase  39.53 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4539  N-acetylmannosamine kinase  39.53 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524903  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0484  ROK familiy protein  38.76 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  27.95 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3410  N-acetylmannosamine kinase  39.53 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3659  N-acetylmannosamine kinase  35.4 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  33.12 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  26.14 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  39.13 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  30.87 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  31.54 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  33.12 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8557  glucose kinase  33.33 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  34.39 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  36.52 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.14 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.14 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  26.56 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  33.33 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1025  sugar kinase  31 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0410056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  34.64 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.33 
 
 		 315 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  25.94 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  30.61 
 
 		 292 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.12 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  31.33 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  30.77 
 
 		 396 aa  52.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  34.69 
 
 		 363 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  30.87 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  31.43 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>