265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4521 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  100 
 
 		 245 aa  497  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  56.38 
 
 		 254 aa  298  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  47.66 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  46.38 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  45.11 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  44.74 
 
 		 235 aa  207  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  44.21 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  42.49 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  39.17 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  36.63 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  35.86 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  35.8 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  34.43 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  36.89 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  33.2 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  34.47 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  33.97 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  34.58 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  32.04 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  35.29 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  32.04 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  36.45 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  32.68 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  35.5 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  31.93 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  32.85 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.86 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  31.56 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  33.33 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  33.02 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.52 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  31.6 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  31.94 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  33.65 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  32.68 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  36.12 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  30.29 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  31.78 
 
 		 278 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  27.73 
 
 		 274 aa  91.7  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  34.83 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  29.83 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  34.83 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  34.83 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  32.52 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  29 
 
 		 275 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  30.77 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.28 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  31.35 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  33.33 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  31.58 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  30.88 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  32.5 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  28.02 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  34.25 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.87 
 
 		 319 aa  62  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.08 
 
 		 316 aa  62  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  24.76 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  32.45 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.5 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  32 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.17 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  31.13 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  30.67 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  25.91 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.24 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  23.2 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  29.88 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  30.81 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  26.4 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.41 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  32.67 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  23.61 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  29.89 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.41 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.33 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  28.86 
 
 		 363 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.41 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  28.72 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  29.26 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  28.81 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  33.88 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  21.71 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  27.05 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  30.67 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  30.67 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.48 
 
 		 311 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  25.48 
 
 		 363 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3045  ROK family protein  25.15 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  29.35 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  24.09 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  30.61 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  23.15 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  30.2 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  30.61 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  27.27 
 
 		 313 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  23.83 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.97 
 
 		 320 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>