98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2098 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  80.09 
 
 		 236 aa  359  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  60.65 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  34.82 
 
 		 270 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  39.06 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  36.1 
 
 		 266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  35.86 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  34.58 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  34.05 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  35.5 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  33.78 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  31.67 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  33.74 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  34.03 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  30.4 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  30.77 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  32.55 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  31.51 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  32.27 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  32.7 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  31.82 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.49 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  29.22 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.36 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  28.77 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  30.77 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  30.77 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  30.77 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.43 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  30.05 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  35.97 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  29.73 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  29.28 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  27.98 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  29.22 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.81 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.64 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  27.52 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  27.73 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  27.93 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  30.54 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  30.82 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  27.67 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  29.28 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  25.46 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  27.99 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  30.63 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  27.35 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  33.08 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  28.57 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.06 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  27.56 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.76 
 
 		 503 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  25.54 
 
 		 281 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  25.97 
 
 		 286 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  25.97 
 
 		 286 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  22.39 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.94 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.52 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  25.94 
 
 		 302 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.22 
 
 		 390 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  28.47 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.38 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  26.25 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  26.25 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  26.54 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  25.49 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  23.48 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.54 
 
 		 315 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  26.27 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  22.95 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  22.95 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  32.17 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  23.77 
 
 		 292 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  22.95 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.92 
 
 		 320 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  24.59 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  22.54 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  22.95 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.11 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  22.54 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  25.62 
 
 		 392 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  25.42 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  28.92 
 
 		 420 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  22.98 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  24.78 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  26.67 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.56 
 
 		 395 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  20.7 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  36.04 
 
 		 399 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  25.93 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  23.03 
 
 		 318 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4328  ROK family protein  22.12 
 
 		 276 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  26.89 
 
 		 420 aa  41.6  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  25.45 
 
 		 280 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  23.17 
 
 		 292 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>