255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2123 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  69.07 
 
 
260 aa  334  7e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  67.49 
 
 
255 aa  330  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  74.9 
 
 
268 aa  330  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  71.19 
 
 
258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  65.98 
 
 
282 aa  317  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  63.93 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  67.33 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  61.94 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  64.63 
 
 
271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  61.07 
 
 
252 aa  288  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  61.57 
 
 
244 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  59.92 
 
 
247 aa  279  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  59.57 
 
 
255 aa  277  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  57.61 
 
 
246 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  57.85 
 
 
253 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  54.62 
 
 
255 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  52.52 
 
 
265 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  56.47 
 
 
253 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  54.58 
 
 
274 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  58.78 
 
 
278 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.88 
 
 
275 aa  254  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  52.46 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  54.59 
 
 
266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  55.37 
 
 
270 aa  252  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  56.12 
 
 
248 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  55.06 
 
 
258 aa  250  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  59.21 
 
 
267 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  55.56 
 
 
270 aa  249  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  58.33 
 
 
267 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  50.42 
 
 
272 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  49.38 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  51.45 
 
 
269 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  51.45 
 
 
269 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  51.45 
 
 
269 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  54.15 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  46.47 
 
 
247 aa  224  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  48.55 
 
 
245 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  37.5 
 
 
235 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  37.34 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  31.6 
 
 
254 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  33.74 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  33.2 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  35.12 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  33.2 
 
 
266 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  34.11 
 
 
257 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  33.2 
 
 
259 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  31.91 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  31.82 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.29 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  33.07 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.05 
 
 
298 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  32.02 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  29.93 
 
 
297 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.05 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.05 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.33 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.69 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.4 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.52 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.83 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  28.29 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  31.55 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  25.42 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  26.51 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  24.56 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  25.66 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  30.26 
 
 
302 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  26.85 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  33.53 
 
 
314 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  27.72 
 
 
313 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  27.08 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  26.34 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  21.71 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  30.77 
 
 
316 aa  59.7  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  25.93 
 
 
301 aa  58.9  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  33.13 
 
 
299 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  28.74 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  34.91 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  24.67 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  29.43 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  24.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  24.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  34.34 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  22.97 
 
 
478 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  36.09 
 
 
340 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  46.67 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  27.09 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.85 
 
 
313 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.53 
 
 
342 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  24.81 
 
 
314 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  30.99 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  23.9 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  27.67 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  25.9 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.58 
 
 
312 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  25 
 
 
299 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  24.17 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  31.1 
 
 
387 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  27.62 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>