70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3110 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  100 
 
 
252 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  77.96 
 
 
257 aa  387  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  71.89 
 
 
255 aa  361  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  69.23 
 
 
256 aa  348  5e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  45.53 
 
 
274 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  37.2 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  39.59 
 
 
270 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  36.4 
 
 
259 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  37.3 
 
 
239 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  36.48 
 
 
235 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  32.39 
 
 
254 aa  155  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  34.43 
 
 
245 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  37.45 
 
 
292 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  31.82 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  29.3 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  33.75 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  30.98 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  33.59 
 
 
255 aa  89  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  30.08 
 
 
270 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  30 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  29.88 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  28.68 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  30.19 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  29.88 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  29.17 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  29.69 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  30.56 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  28.08 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  30 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  25.76 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  27.48 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  29.69 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  27.91 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  30.08 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  33.2 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  26.54 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  26.92 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  27.06 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  28.82 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  29.07 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  27.31 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  28.76 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  26.34 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  27.5 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  27.5 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  27.5 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  27.53 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  24.29 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  30.15 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  29.73 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  29.18 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  29.34 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  30 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  30.3 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  26.87 
 
 
319 aa  49.3  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.87 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  31.45 
 
 
363 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  27.74 
 
 
409 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  26.85 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  43.28 
 
 
329 aa  45.4  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  29.19 
 
 
316 aa  45.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  31.01 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.7 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.7 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  30 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  31.52 
 
 
306 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.92 
 
 
443 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  31.62 
 
 
425 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.67 
 
 
298 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.86 
 
 
410 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>