More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2928 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02303  predicted diguanylate cyclase  54.68 
 
 
729 aa  818    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0130246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  54.82 
 
 
729 aa  820    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02264  hypothetical protein  54.68 
 
 
729 aa  818    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2668  diguanylate cyclase  60.44 
 
 
729 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2928  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 
731 aa  1503    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0860795  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2532  diguanylate cyclase  54.68 
 
 
729 aa  818    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000224298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2545  diguanylate cyclase  54.55 
 
 
729 aa  818    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00846864  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2774  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  60.3 
 
 
729 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2553  diguanylate cyclase  60.44 
 
 
729 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000552391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  54.82 
 
 
729 aa  820    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176543  hitchhiker  0.0066798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3625  diguanylate cyclase  54.68 
 
 
729 aa  820    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2684  diguanylate cyclase  54.82 
 
 
729 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000254725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2602  diguanylate cyclase  60.3 
 
 
729 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116026  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2644  diguanylate cyclase  60.3 
 
 
729 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3543  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.99 
 
 
750 aa  344  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02395  predicted inner membrane protein  30.72 
 
 
747 aa  326  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3726  putative cytochrome C-type biogenesis protein  30.58 
 
 
747 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.467622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2699  inner membrane protein YfgF  30.97 
 
 
737 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.995527 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02357  hypothetical protein  30.72 
 
 
747 aa  326  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2786  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.58 
 
 
747 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.491655  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2763  hypothetical protein  30.97 
 
 
737 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1166  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.58 
 
 
747 aa  324  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2651  inner membrane protein YfgF  30.97 
 
 
737 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.58 
 
 
747 aa  324  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0079949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2651  putative cytochrome C-type biogenesis protein  30.45 
 
 
747 aa  324  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2741  inner membrane protein YfgF  30.97 
 
 
737 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.306785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2872  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.83 
 
 
737 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2992  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.2 
 
 
746 aa  301  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.741297  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2786  diguanylate cyclase  47.46 
 
 
186 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0254496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0441  sensory box protein  29.61 
 
 
870 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0388  putative diguanylate phosphodiesterase  37.08 
 
 
837 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4041  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.29 
 
 
859 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3919  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.29 
 
 
859 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3845  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.29 
 
 
859 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04978  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.02 
 
 
734 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3960  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.74 
 
 
965 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.283366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.06 
 
 
856 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4371  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.1 
 
 
960 aa  150  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.73 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001950  sensory box/GGDEF family protein  36.51 
 
 
1041 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.38 
 
 
848 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4292  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.15 
 
 
772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.832066  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2973  GGDEF domain-containing protein  29.27 
 
 
734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0171  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.21 
 
 
808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000289521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00193  predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain  28.7 
 
 
945 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0440  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.41 
 
 
856 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.41 
 
 
856 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3405  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.05 
 
 
859 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0437  sensory box protein  27.92 
 
 
856 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3414  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.86 
 
 
673 aa  147  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  28.51 
 
 
568 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3687  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.57 
 
 
739 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0581  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.57 
 
 
739 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3416  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.73 
 
 
857 aa  144  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.575595  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3870  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.47 
 
 
739 aa  144  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3744  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.47 
 
 
739 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0292  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.75 
 
 
870 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1534  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.11 
 
 
642 aa  142  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.376143  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  34.48 
 
 
685 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.86 
 
 
799 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.816618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  33.73 
 
 
689 aa  140  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3166  GGDEF domain-containing protein  28 
 
 
755 aa  140  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00528  hypothetical protein  34.02 
 
 
1049 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.29 
 
 
709 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200253  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3272  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.28 
 
 
753 aa  138  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  28.31 
 
 
685 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2653  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.17 
 
 
770 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.953805  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0660  triosephosphate isomerase  28.91 
 
 
855 aa  138  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146295  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.74 
 
 
857 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3914  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.69 
 
 
918 aa  137  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.161625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4011  diguanylate cyclase  28.31 
 
 
817 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237804  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3251  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.38 
 
 
732 aa  137  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.310798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0621  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.17 
 
 
728 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5279  RNase II stability modulator  28.04 
 
 
666 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164085  normal  0.0978812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3409  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.17 
 
 
728 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.623835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.17 
 
 
728 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669177  normal  0.626171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  28.07 
 
 
817 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.866609 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6051  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.61 
 
 
981 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0628  GGDEF domain-containing protein  34.58 
 
 
728 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  27.55 
 
 
571 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1162  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.7 
 
 
587 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913114 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  36.59 
 
 
536 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0106  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.44 
 
 
1002 aa  134  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6232  hypothetical protein  30.88 
 
 
951 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2021  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  32.65 
 
 
811 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.32 
 
 
632 aa  134  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.407657  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  28.07 
 
 
1209 aa  133  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1326  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
1002 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.121951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.48 
 
 
683 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  27.66 
 
 
1209 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0235394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.8 
 
 
685 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.57 
 
 
575 aa  133  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.24 
 
 
817 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1592  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.94 
 
 
823 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000214692  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  27.99 
 
 
1228 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2511  sensory box/GGDEF family protein  27.73 
 
 
873 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.064044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.57 
 
 
735 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3694  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  27 
 
 
678 aa  132  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.323415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.27 
 
 
954 aa  132  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0834  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.88 
 
 
831 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.153138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>