16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2786 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02303  predicted diguanylate cyclase  100 
 
 		 729 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0130246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 		 729 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2532  diguanylate cyclase  100 
 
 		 729 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000224298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2684  diguanylate cyclase  100 
 
 		 729 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000254725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 		 729 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176543  hitchhiker  0.0066798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3625  diguanylate cyclase  100 
 
 		 729 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02264  hypothetical protein  100 
 
 		 729 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0109943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2786  diguanylate cyclase  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0254496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2545  diguanylate cyclase  97.84 
 
 		 729 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00846864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2602  diguanylate cyclase  62.78 
 
 		 729 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2644  diguanylate cyclase  62.78 
 
 		 729 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2553  diguanylate cyclase  62.22 
 
 		 729 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000552391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2668  diguanylate cyclase  62.22 
 
 		 729 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2774  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  62.22 
 
 		 729 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2928  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  47.46 
 
 		 731 aa  185  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0860795  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3543  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.37 
 
 		 750 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>