More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2032 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
406 aa  836    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.252984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  45.48 
 
 
403 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  45.48 
 
 
403 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  44.72 
 
 
403 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  45.23 
 
 
403 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  45.23 
 
 
403 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  45.23 
 
 
403 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  45.23 
 
 
403 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1757  diguanylate phosphodiesterase  45.09 
 
 
418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388257  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  38.04 
 
 
390 aa  269  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  35.4 
 
 
254 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  34.48 
 
 
266 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  35.71 
 
 
260 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  36.63 
 
 
291 aa  156  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  37.16 
 
 
239 aa  156  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  33.48 
 
 
260 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  35.81 
 
 
332 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  32.47 
 
 
262 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  34.62 
 
 
252 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 
257 aa  144  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  32.59 
 
 
259 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  34.88 
 
 
257 aa  143  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  34.2 
 
 
263 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  31.44 
 
 
255 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  35.84 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  35.4 
 
 
246 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 
253 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  33.77 
 
 
256 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  29.96 
 
 
254 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 
253 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  33.19 
 
 
257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 
251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  33.93 
 
 
258 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  33.94 
 
 
258 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  34.06 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  34.23 
 
 
259 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 
248 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  33.62 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  32.74 
 
 
283 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  29.66 
 
 
371 aa  126  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 
259 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  30.84 
 
 
357 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  32.74 
 
 
265 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  34.35 
 
 
601 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  34.35 
 
 
582 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  32.78 
 
 
356 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  31.7 
 
 
351 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  32.88 
 
 
258 aa  123  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  34.23 
 
 
590 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  31.65 
 
 
249 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.96 
 
 
723 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.98 
 
 
584 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0159  GGDEF domain-containing protein  34.17 
 
 
742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.43432  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  34.08 
 
 
590 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  28.81 
 
 
340 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  31.16 
 
 
256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  30.51 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 
265 aa  120  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.61 
 
 
786 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  32.92 
 
 
284 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.88 
 
 
853 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000400428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4273  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.75 
 
 
754 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  31.96 
 
 
257 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  31.96 
 
 
257 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  33.48 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  31.96 
 
 
257 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  31.96 
 
 
257 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1144  GGDEF domain-containing protein  31.88 
 
 
754 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0583  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.76 
 
 
743 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.98 
 
 
853 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
745 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  31.74 
 
 
257 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.08 
 
 
596 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5652  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.3 
 
 
1061 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7376  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.6 
 
 
736 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00065  GGDEF/EAL domain protein  33.33 
 
 
814 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  32.27 
 
 
259 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  33.79 
 
 
592 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.7 
 
 
753 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.08 
 
 
714 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.02 
 
 
734 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1178  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.75 
 
 
754 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.578414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3194  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.12 
 
 
726 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178802  normal  0.0329837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.22 
 
 
590 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5008  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.35 
 
 
708 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100946  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30 
 
 
754 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268415  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  32.28 
 
 
306 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.19 
 
 
580 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3768  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.03 
 
 
765 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0661883  normal  0.152244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0050  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 
742 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  32.27 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0507  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.64 
 
 
706 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2379  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.69 
 
 
573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1252  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.16 
 
 
760 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.849617  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.13 
 
 
797 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.78 
 
 
708 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.47 
 
 
883 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.26 
 
 
773 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>