More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1757 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1757  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 418 aa  865    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388257  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  63.87 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  63.87 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  63.87 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  63.31 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  63.87 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  63.87 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  63.87 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  45.09 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  34.97 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  37.29 
 
 		 239 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  36.52 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  36.68 
 
 		 260 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  36.12 
 
 		 254 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  34.65 
 
 		 266 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  36.09 
 
 		 257 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  36.05 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  34.19 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  35.27 
 
 		 252 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  35.09 
 
 		 257 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  35.86 
 
 		 257 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  36 
 
 		 263 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  35.93 
 
 		 259 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  33.92 
 
 		 253 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  35.4 
 
 		 258 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 		 262 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  36.17 
 
 		 248 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  34.96 
 
 		 258 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  34.48 
 
 		 332 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  31.88 
 
 		 257 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  34.32 
 
 		 283 aa  126  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  31.88 
 
 		 254 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  30.74 
 
 		 255 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  32.47 
 
 		 256 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  33.9 
 
 		 265 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 246 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 246 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  33.9 
 
 		 265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  33.48 
 
 		 256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 356 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  32.46 
 
 		 251 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.74 
 
 		 584 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 257 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 257 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 257 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 		 257 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 259 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2231  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.91 
 
 		 699 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.25 
 
 		 786 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.7 
 
 		 753 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.65 
 
 		 797 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  32.76 
 
 		 257 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.73 
 
 		 773 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  29.65 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1138  diguanylate phosphodiesterase  31.3 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  32.22 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.67 
 
 		 599 aa  104  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2213  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.04 
 
 		 742 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  29.55 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.57 
 
 		 584 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  29.13 
 
 		 584 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.28 
 
 		 766 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2057  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.64 
 
 		 699 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  32.11 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.39 
 
 		 580 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.09 
 
 		 698 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330245  normal  0.58075 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.7 
 
 		 583 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  29.41 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.18 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.7 
 
 		 583 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.18 
 
 		 585 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.18 
 
 		 585 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  26.96 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.7 
 
 		 584 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  28.18 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.38 
 
 		 632 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  29.57 
 
 		 582 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.48 
 
 		 581 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.18 
 
 		 585 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  29.57 
 
 		 601 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.31 
 
 		 596 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  32.02 
 
 		 1502 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.14 
 
 		 590 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.9 
 
 		 572 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0430  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.91 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.42 
 
 		 733 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.24261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.36 
 
 		 883 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.27 
 
 		 800 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.06 
 
 		 696 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.18 
 
 		 723 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1605  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 		 688 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0013251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  29.13 
 
 		 592 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  28.32 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0050  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.86 
 
 		 810 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.237311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1331  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.51 
 
 		 709 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.983371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  27.39 
 
 		 590 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0630  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 		 699 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>