More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3798 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 257 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  99.61 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  98.44 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  96.11 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  91.83 
 
 		 258 aa  501  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  65.59 
 
 		 259 aa  347  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  52.03 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  49.19 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  51.61 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  51.02 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  49.8 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  47.7 
 
 		 263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  48.94 
 
 		 266 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  47.9 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  47.66 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  49.79 
 
 		 253 aa  238  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  51.05 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  48.09 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  48.59 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  44.13 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  47.72 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  44.53 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  49.17 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  45.12 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  49.15 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  45.75 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  47.3 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  49.16 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  46.89 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  47.41 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  47.41 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  47.52 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  46.77 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  46.64 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  46.25 
 
 		 291 aa  215  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  45.99 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  42.92 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  44.68 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0792  diguanylate phosphodiesterase  47.27 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  42.44 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  37.95 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  37.39 
 
 		 351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  34.98 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  36 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 753 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 352 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.73 
 
 		 734 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.05 
 
 		 773 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  33.86 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  34.75 
 
 		 356 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  32.72 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  32.72 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1138  diguanylate phosphodiesterase  35.59 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.58 
 
 		 883 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.8 
 
 		 797 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  32.52 
 
 		 357 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.59 
 
 		 592 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.19 
 
 		 605 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.7 
 
 		 581 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.28 
 
 		 766 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.56 
 
 		 632 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32 
 
 		 599 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.47 
 
 		 590 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  31.96 
 
 		 406 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  34.4 
 
 		 475 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.84 
 
 		 584 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.4 
 
 		 580 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  30.74 
 
 		 390 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  29.57 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.57 
 
 		 786 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1757  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 418 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388257  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.39 
 
 		 585 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.39 
 
 		 585 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  31.53 
 
 		 584 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.39 
 
 		 585 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.39 
 
 		 585 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.65 
 
 		 583 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.65 
 
 		 583 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.53 
 
 		 584 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.53 
 
 		 572 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.65 
 
 		 584 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  29.82 
 
 		 437 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00704  sensory box/GGDEF/EAL domain protein  33.33 
 
 		 852 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.44 
 
 		 800 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 584 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1552  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.29 
 
 		 947 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.32 
 
 		 611 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.26 
 
 		 590 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  29.63 
 
 		 828 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  30.32 
 
 		 601 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1985  diguanylate phosphodiesterase  30.53 
 
 		 485 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  31.98 
 
 		 403 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  31.98 
 
 		 403 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0330  diguanylate cyclase  32 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.98 
 
 		 403 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  31.98 
 
 		 403 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.98 
 
 		 403 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  31.98 
 
 		 403 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  29.96 
 
 		 454 aa  106  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.98 
 
 		 403 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>