More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1528 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
290 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  66.9 
 
 
574 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  65.49 
 
 
574 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
301 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.49 
 
 
326 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
300 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 
306 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.1 
 
 
306 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
302 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 
306 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 
306 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
304 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
287 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
303 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
299 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
287 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
306 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
710 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
298 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  30.6 
 
 
286 aa  148  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  32.99 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  32.99 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
303 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
315 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
913 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
287 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
287 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
302 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
305 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
305 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  32.05 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
292 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  32.84 
 
 
901 aa  129  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  29.35 
 
 
903 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  32.28 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
324 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
324 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
324 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
298 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
324 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
302 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
307 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
300 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  30.82 
 
 
893 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
312 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
320 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  28.96 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000504065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.339496  normal  0.553858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00693631  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.260501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
312 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
303 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
308 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  27.91 
 
 
305 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 
293 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 
306 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
306 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00337354  hitchhiker  0.000000292198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
294 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0588577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
332 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
259 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0536617  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.19 
 
 
253 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.31 
 
 
305 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
306 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
317 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.22 
 
 
305 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  26.82 
 
 
304 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.08 
 
 
317 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
295 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
294 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
300 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
301 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.55 
 
 
258 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
318 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890944  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>