More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0311 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.32 
 
 
295 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.64 
 
 
295 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.64 
 
 
295 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.27 
 
 
309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.48 
 
 
299 aa  329  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
287 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
271 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4264  hypothetical protein  53.38 
 
 
151 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  35.29 
 
 
236 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.8 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.68 
 
 
247 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 
295 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
251 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
254 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
251 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
249 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
261 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2396  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.94 
 
 
248 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2466  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.94 
 
 
248 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000110753  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2558  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.94 
 
 
248 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000120967  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2776  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
298 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  38.39 
 
 
254 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.86 
 
 
250 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  33.02 
 
 
274 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
252 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.86 
 
 
250 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
285 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.85 
 
 
246 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
250 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
253 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 
249 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.27 
 
 
248 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 
285 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
286 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6325  putative short-chain dehydrogenase  35.21 
 
 
260 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
276 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.011223  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
285 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 
285 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
252 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 
285 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
247 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2910  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.44 
 
 
249 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26924  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.44 
 
 
249 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
255 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
246 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
285 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
295 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
253 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 
247 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
284 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
252 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  33.19 
 
 
265 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
272 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
284 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
284 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
248 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
268 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04541  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.13 
 
 
250 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0716484  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
292 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.52 
 
 
247 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.03 
 
 
249 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
295 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
285 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
254 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
252 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72880  putative short-chain dehydrogenase  34.74 
 
 
260 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
249 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.57 
 
 
247 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
249 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0459105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
288 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
285 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.1 
 
 
249 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
254 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
287 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
246 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>