More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0562 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0562  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 236 aa  445  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  48.85 
 
 		 397 aa  184  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  44.13 
 
 		 392 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 425 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 199 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 409 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.98 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.87 
 
 		 417 aa  85.9  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  42.41 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.65 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 405 aa  82.4  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  29.35 
 
 		 479 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  42.59 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  24.42 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  29.9 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.21 
 
 		 481 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 479 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.44 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  36.96 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  26.26 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.76 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  42.41 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  30.73 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  29.1 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  36.15 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.46 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.42 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  27.89 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>