60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4326 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  69.64 
 
 		 364 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  43.29 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  41.94 
 
 		 385 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  39.15 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  39.79 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  39.95 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  37.43 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  41.12 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  33.18 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  37.7 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  33.02 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  35.47 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.28 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1314  hypothetical protein  32.12 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000126062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3117  hypothetical protein  33.54 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  35.38 
 
 		 376 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  34.33 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  35.39 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0947  hypothetical protein  32.54 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00120795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  30.57 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3504  hypothetical protein  32.4 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1214  hypothetical protein  34.3 
 
 		 378 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.011285  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3039  hypothetical protein  33.24 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000596347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2932  hypothetical protein  31.62 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000352227  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1147  hypothetical protein  32.21 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.076201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1181  hypothetical protein  31.69 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3208  hypothetical protein  32.13 
 
 		 384 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3014  hypothetical protein  31.5 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3111  hypothetical protein  31.84 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1087  hypothetical protein  31.27 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.339397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  33.78 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1079  hypothetical protein  30.97 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0378973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  28.57 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1118  hypothetical protein  33.42 
 
 		 387 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0402787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  30.19 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1103  hypothetical protein  30.69 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.183133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1003  hypothetical protein  31.19 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2703  hypothetical protein  29.05 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179653  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  30.71 
 
 		 373 aa  125  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  27.59 
 
 		 388 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  27.25 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  28.19 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0516  hypothetical protein  27.47 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.108385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  31.79 
 
 		 573 aa  86.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  25.48 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1707  hypothetical protein  25.6 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0417  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  26.11 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  23.01 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  35.24 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  33.65 
 
 		 401 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  33.06 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  31.37 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  31.45 
 
 		 245 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  29.73 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  31.96 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  29.13 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  27.23 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  29.8 
 
 		 244 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  25.65 
 
 		 249 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>