32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5069 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5069  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  770    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.511393  normal  0.074715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2702  hypothetical protein  57.07 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.523267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1233  hypothetical protein  43.8 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460296  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2036  hypothetical protein  38.54 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997579  normal  0.0998645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4992  hypothetical protein  37.37 
 
 		 395 aa  235  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2674  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  25.81 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4975  hypothetical protein  24.63 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1626  hypothetical protein  42.22 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2495  hypothetical protein  32.38 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  35.24 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1258  hypothetical protein  36.46 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1534  hypothetical protein  35.63 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1632  hypothetical protein  41.11 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4820  hypothetical protein  36.46 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6469  hypothetical protein  43.48 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0413  hypothetical protein  24.05 
 
 		 358 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1463  hypothetical protein  24.73 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5410  Protein of unknown function DUF2261, transmembrane  44.87 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3034  hypothetical protein  36.47 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4143  hypothetical protein  41.1 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.454782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4208  hypothetical protein  29.63 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3420  hypothetical protein  32.29 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6587  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  31.31 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1032  hypothetical protein  38.89 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3756  hypothetical protein  32.61 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6602  Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04319  hypothetical protein  32.67 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1515  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0949  hypothetical protein  28.71 
 
 		 573 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.328812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3263  hypothetical protein  32.46 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4173  hypothetical protein  26.36 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964624 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0502  putative transmembrane protein  38.75 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.326971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>